L’ensemble des eaux du bassin versant est de qualité passable (couleur jaune dans la grille d’évaluation de la qualité de l’eau des cours d’eau / SEQ-Eau). Deux paramètres sont déclassants : les nitrates et le phosphore total.
La majorité du linéaire des cours d’eau est de qualité passable. Le ruisseau d’Aigueperse est en rouge à cause d’un taux de matière en suspension très élevé. Cela peut s’expliquer par la présence d’animaux traversant le cours d’eau en amont du point de prélèvement.